论文阅读 | SMART:A High-Performance Adaptive Radix Tree for Disaggregated Memory

文章提出了一个适用于分离式内存架构的基数树。主要工作由复旦大学和华为云完成,发表于OSDI'23。

Paper Link: https://www.usenix.org/conference/osdi23/presentation/luo
Open Source: https://github.com/dmemsys/SMART

分离式内存(Disaggregated Memory,DM)最近几年发展得如火如荼,先前已经有不少研究探讨DM上的索引结构了。B+树作为使用最广的索引结构,自然已经有人研究过怎么将它适配于DM,比如说Sherman

但是B+树也有它的问题:读写放大。这一点主要体现在对叶子节点的读写上,B+树的每个叶子节点保存了多个Key-Value(KV)对,运行在计算节点上的进程要搜索某一个Key时,得把整个叶子节点都读回来。假设一个叶子节点包含了32个KV对,那就有32倍的读放大。写放大也是一样的道理。尽管Sherman对B+树的写做了优化,解决了写放大问题,但读放大问题依然存在。读写放大问题在DM架构上的影响还是非常明显的,毕竟浪费的是网络带宽。文章就做了些实验比较Sherman和ART(SOTA基数树),总结了两个结论:

图1 Sherman和ART在YCSB
  • B+树的吞吐量受到了带宽的限制。这一点可以很容易从图1的(a)和(b)看出来,随着客户端数量上升,Sherman的吞吐量首先达到上限,ART的吞吐量上限是Sherman的两倍还多。而且单个叶子节点存放的KV对越多,Sherman的吞吐量越低。可能大伙觉得,多读回来的数据可以作为缓存啊,这不就把读放大问题完美解决。但是实验(c)显示,即使给到了600MB的缓存,吞吐量依然受限于网络带宽无法继续提升(文章没有做解释)。相反,ART的吞吐上限受制于RNIC的IOPS,比Sherman好很多。

  • 网络拥塞的提前发生加剧了B+树的延迟。在相同吞吐量下,由于读写放大,Sherman占用的网络带宽比ART高得多,这导致了网络拥塞提前发生。一旦网络拥塞发生,延迟就开始提高了。从实验(d)可以看出来,Sherman的P99延迟增长速度是相当快。

基于这两个观察,文章就得出一个结论:比起B+树,基数树更适合用于DM架构。当然ART也不是完美的,要想将ART适配于DM架构,仍然有三个问题需要解决:

  • 有锁并发控制导致写性能低下。现有的ART都使用了有锁并发控制来实现同步。但是在DM架构上,锁操作开销是很大的,每一次锁操作都是一次网络往返(RDMA_CAS)。而且,忙等待之类的锁冲突机制还会在上锁失败时不断重试,进一步加剧RNIC的IOPS浪费。一个可能的解决方案是设计无锁算法。但是无锁算法依赖于out-of-place的更新模式(只更新8字节地址保证更新的原子性)。但是这种更新模式又会导致计算节点本地缓存的频繁失效,造成缓存抖动问题。

  • 同节点客户端的重复I/O浪费RNIC的IOPS。前面有提到,ART能够突破B+树受到的带宽限制,但依然受限于RNIC的IOPS。IOPS吃紧的情况下,还是有浪费的情况。比如说,位于同一个计算节点的多个客户端,要读内存池的同一个KV对,每个客户端都会发起一个网络I/O,这种不必要的重复I/O就是对IOPS的严重浪费了。写也是同理。

  • ART的结构特征加剧了计算端缓存失效问题。路径压缩和适应性节点(根据需要修改节点内指针数组长度)是ART降低内存开销重要的结构特征。但这就会引入ART内部节点父子关系的变化或节点类型变化等等问题,进而引入计算端缓存失效的可能性。如果没有合适的判别机制,可能会导致错误的数据访问。

本文就针对前面提出的三点挑战,进行了针对性设计,提出了SMART,一个面向DM架构的高性能ART。

SMART

SMART针对三点挑战,分别提出了三个设计来解决问题。

层次化的ART并发控制

图2 SMART的内部节点和叶子节点

SMART的节点被分为内部节点(Internal Node)叶子节点(Leaf Node)两种。所谓层次化的并发控制,意思就是内部节点采用无锁并发,而叶子节点采用有锁并发。

内部节点主要由三个部分组成。第一部分是Reverse Pointer,这里存储指向父节点的指针;第二部分是Header,存放了当前节点深度Depth、节点类型Typenode(NODE_4/NODE_16/NODE_64/NODE_256)、压缩的Partial Key数组和当前数组大小Sizearray;第三部分就是Slot数组,保存了子节点的信息,每个Slot由对应Partial Key、是否为叶子节点的标记位Leaf、子节点类型Typenode(若为内部节点)或子节点长度(若为叶子节点),以及48位地址组成。

叶子节点也由若干部分构成,包括指向父节点的Reverse Pointer,用于标记KV是否被删除的有效位Valid,校验和Checksum,固定长度的KV对,以及在尾部的锁Lock。

发现了么?SMART把内部节点的每一部分都设计为了8字节大小,这样就可以直接使用RDMA CAS操作直接原子地进行修改了,不用上锁。而对于叶子节点,仍然采用了锁机制。写者之间会直接用互斥锁进行同步,在写之前进行上锁;读者则采用乐观策略,将节点内容读回后通过校验和检查内容是否一致,不一致则重新读。此外,可以看到SMART将锁放置在了叶子节点的尾部,这样客户端就可以在写回数据的时候顺便释放锁了,因为RDMA保证了写的顺序性,释放锁时前面的数据一定已经完成修改了。

为了更好地展示SMART的各种操作,文章用图展示了对一颗ART树进行一系列操作的变换过程:

图3 SMART的一系列操作变化过程

读委托写合并

这个机制用于解决同一计算节点上不同客户端对相同Key重复读的I/O浪费问题。

图4 读委托

SMART客户端在读时会对Key计算一个哈希值,并且在尝试在本地对这个哈希值上锁,成功上锁的客户端就会开始执行正常的RDMA读流程,并且进入一个读时间窗口(Time Window)。如果上锁失败,则说明这个哈希值已经被其它客户端上锁了,这时候就会去比较被上锁的Key(也就是正在执行读的Key)究竟是不是同一个Key。如果不是同一个Key,那客户端就会直接进入正常的读流程,从内存池读回目标KV对;如果是同一个Key,那客户端就不会去内存池读,而是进入一个等待队列。持有锁的客户端在读回目标KV后,会将它分享给等待队列中的每一个客户端,从而就可以通过一次网络I/O完成多个读操作。

图5 写合并

写合并也是差不多的思路。成功拿到锁的客户端会维护一个写缓存(WCB),在写窗口期间,其它客户端对同一个Key的写都会转变成对WCB的写。和读委托稍微不同的是,写时间窗口在持有锁的客户端给目标叶子节点上锁后就结束了。在成功对叶子节点上锁后,持有锁的客户端就会将WCB内的值写入内存池,从而完成写操作。如此一来,多个客户端对同一Key的写也由一次网络I/O完成。

但是简单将读委托和写合并一起实施,也会有问题。例如A发起对K的读,B对K先写后读。A先从内存池读到K的旧值,但数据仍然还在网络通路上。随后B将新值写入内存池,然后发起读加入等待队列。A读的数据返回计算节点,分享给B,此时从B的视角看就是写入的新值没能成功读回,因果一致性遭到破坏。所以,为了让避免这种情况发生,SMART设计了一种机制,简单地来说,当读写并发的时候,如果写比读先完成(网络先返回),那当读数据返回时,只有写完成之前发起请求的读者可以被共享数据,其余读者需要自行发起网络请求读取新数据。(这一部分论文没有交代清楚,强烈建议看代码是怎么实现的)。

ART缓存

图6 计算节点的ART缓存

SMART客户端会在本地节点也维护一棵ART缓存树,它的结构如图6所示。缓存树的叶子节点就是缓存条目,缓存了内存池中某个内部节点的信息:深度Depth、节点地址Node Address、以及它的子节点信息Slot数组(这里的Slot和前面提到的内存池的Slot结构一致)。那要怎么判断缓存是否还有效呢?文章分了三大缓存失效场景类型来讨论:

  • 父子节点关系的变化。这种缓存失效类型一般发生在节点分裂。验证方法是根据缓存条目的目标Slot读回目标节点数据,然后比较读回数据中的Reverse Pointer和缓存条目的Node Address是否相同,即可判断缓存是否失效。

  • 节点类型发生变化。验证方式是,根据缓存条目的目标Slot读回目标节点数据,查看读回数据中的Typenode和缓存中的Typenode是否相同,即可判断缓存是否失效。

  • 节点是否删除。对于内部节点,验证读回的数据中Typenode是否为NODE_0,判断节点是否已删除;对于叶子节点,验证读回数据中的Valid位,以判断节点是否已删除。

实验

直接看论文吧。

结论

文章针对DM架构上B+树读写放大严重的问题,设计了适用于DM架构的基数树SMART。其中精心设计了树的节点数据结构,使得内部节点可以利用RDMA CAS操作实现无锁并发控制。同时为了保留对叶子节点的in-place-update更新模式,对叶子节点的更新仍然采用有锁并发控制,但是将锁放置在节点最后,利用RDMA更新的顺序保证,优化网络I/O次数。

比较亮眼的是读委托写合并机制,这个实打实降低了对热点Key访问的网络I/O次数,最重要的是这个机制对上层是透明的,可以移植在其它场景下,优化网络I/O。


论文阅读 | SMART:A High-Performance Adaptive Radix Tree for Disaggregated Memory
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作者
ztorchan
发布于
2023年9月23日
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